Выставлять ли организации-посреднику покупателям счет-фактуру с выделенной суммой налога при реализации товаров по поручению заказчика, но от своего имени, если организация не является плательщиком этого налога? Заказчиком является российская или иностранная организация, которая состоит на налоговом учете в России

Выставлять нужно, если посредник реализует товары по ценам, которые заказчик установил с учетом НДС.

Товар (результат выполненных работ, оказанных услуг), переданный посреднику, является собственностью заказчика (п. 1 ст. 996, ст. 1011 Гражданского кодекса РФ). Реализация товаров (выполнение работ, оказание услуг) на территории России признается объектом налогообложения НДС (п. 1 ст. 146 Налогового кодекса РФ).

В Налоговом кодексе РФ нет специальных положений, которые регулируют порядок выставления счетов-фактур посредниками. В ст. 168 Налогового кодекса РФ установлен общий порядок выставления счетов-фактур, а в п. 1 ст. 169 Налогового кодекса РФ есть указание на то, что счет-фактура, выставленный посредником, который действует от своего имени, является основанием для вычета у покупателя. Вычет применяется и в том случае, если посредник не является плательщиком НДС (письмо Минфина России № 03-07-11/82 от 26 марта 2012 г.).

Мнение Минфина России и ФНС России: при реализации товаров (выполнении работ, оказании услуг) по поручению заказчика, но от своего имени посредник (не плательщик НДС) должен выставлять в адрес покупателя счет-фактуру. Факт выставления таких документов не приводит к обязанности посредника уплачивать НДС в бюджет со стоимости товаров (работ, услуг), реализуемых по поручению заказчика.
Подтверждение: письма Минфина России № 03-11-11/123 от 28 апреля 2010 г., ФНС России № ШС-22-3/85 от 4 февраля 2010 г.

Вывод: если посредник не является плательщиком НДС (например, в связи с применением УСН), но реализует товары по ценам, установленным заказчиком с учетом налога, он должен выставить счет-фактуру и зарегистрировать его в журнале учета полученных и выставленных счетов-фактур (п. 3.1 ст. 169 Налогового кодекса РФ). Обязанность уплатить НДС у него в этом случае не возникает (п. 2, 3 ст. 346.11, абз. 3 п. 4 ст. 346.26, п. 3 ст. 346.1 Налогового кодекса РФ). При этом покупатель товаров (работ, услуг) сможет принять НДС к вычету по такому счету-фактуре в общем порядке (п. 1 ст. 169 Налогового кодекса РФ, письмо Минфина России № 03-07-11/82 от 26 марта 2012 г.). Если же заказчик не является плательщиком НДС, то посредник выставлять счет-фактуру не должен.