Начислять нужно, если образовательные услуги предоставляет коммерческая организация.
В пп. 14 п. 2 ст. 149 Налогового кодекса РФ сказано, что услуги в сфере образования по проведению некоммерческими образовательными организациями учебно-производственного процесса по направлениям основного и дополнительного образования, указанным в лицензии, не облагаются НДС.
В отношении образовательных услуг, оказываемых коммерческими организациями (в частности, унитарными предприятиями), подобных положений Налоговый кодекс РФ не содержит (письмо Минфина России № 03-07-14/24318 от 22 мая 2014 г.).
Вывод: начислять НДС на стоимость образовательных услуг должна только коммерческая организация, которая эти услуги оказывает (п. 1 ст. 143 Налогового кодекса РФ).