Является ли плательщиком организация (ИП), которая при государственной регистрации указала виды деятельности, подпадающие под спецрежим, но фактически их не ведет?

Не является плательщиком ЕНВД, если не встала на учет в качестве плательщика в рамках данного спецрежима.

Организации (индивидуальные предприниматели), которые решили перейти на уплату ЕНВД по определенным видам деятельности, подпадающим под данный спецрежим, обязаны встать на учет в налоговой инспекции по данному основанию (п. 2 ст. 346.28 Налогового кодекса РФ). При этом переход на данный режим является добровольным и обязанность регистрации как плательщика ЕНВД связана с фактическим ведением тех видов деятельности, которые облагаются единым налогом.
Подтверждение: письмо Минфина России № 03-11-11/210 от 17 августа 2011 г. (в части отсутствия оснований для постановки на учет в качестве плательщика ЕНВД) – его выводы верны и в настоящее время, когда переход на ЕНВД носит добровольный характер.

Вместе с тем если организация (предприниматель) зарегистрировалась в качестве плательщика ЕНВД, но не ведет деятельность (приостановила ее), то она признается плательщиком ЕНВД на общих основаниях и обязана исполнять обязанность по представлению декларации по этому налогу вплоть до момента снятия с учета в качестве плательщика ЕНВД. При этом представление "нулевых" деклараций (деклараций с нулевым физическим показателем) не допускается.

Вывод: организация (предприниматель), которая при государственной регистрации и внесении сведений в ЕГРЮЛ (ЕГРИП) указала виды деятельности, подпадающие под спецрежим в виде ЕНВД, но фактически их не ведет, не признается плательщиком ЕНВД, если не встала на учет в качестве плательщика в рамках данного спецрежима.