По какой стоимости принимать к учету нематериальный актив, приобретенный (созданный) до перехода организации с уплаты ЕНВД на ОСНО? Нематериальный актив был приобретен (создан) в период применения системы налогообложения в виде ЕНВД

Принимать нужно по остаточной стоимости.

Мнение Минфина России: организация при переходе с ЕНВД на ОСНО должна определять остаточную стоимость амортизируемого имущества для принятия к налоговому учету в порядке, аналогичном действующему при переходе с ЕНВД на УСН (объект налогообложения — доходы, уменьшенные на расходы) (письмо № 03-11-06/3/35 от 19 февраля 2009 г.).

То есть остаточную стоимость нематериального актива нужно рассчитывать как разницу между ценой приобретения (создания) нематериального актива и суммой начисленной в бухгалтерском учете амортизации за время применения специального режима налогообложения (абз. 4 п. 2.1 ст. 346.25 Налогового кодекса РФ).

При этом если после перехода на ОСНО организация при расчете налога на прибыль применяет кассовый метод, в налоговом учете можно отразить только полностью оплаченные нематериальные активы (пп. 3 п. 3 ст. 273 Налогового кодекса РФ).