Распределять ли, если на момент приобретения дальнейшее использование товаров (работ, услуг) в облагаемых и (или) необлагаемых операциях неизвестно?

Единая точка зрения по этому вопросу не выработана.

Если право на вычет НДС возникло у организации (ИП) сразу после приобретения и принятия на учет товаров (работ, услуг), то при отсутствии определенности в целях их использования (например, при закупке партии товаров для продажи оптом и в розницу с применением для последней ЕНВД и в других ситуациях) можно выбрать один из следующих вариантов:

А) Всю сумму входного налога принять к вычету, посчитав такие товары (работы, услуги) предназначенными для использования в облагаемых НДС операциях (п. 2 ст. 171, п. 1 ст. 172 Налогового кодекса РФ). Если в дальнейшем часть товаров (работ, услуг), по которым налог был принят к вычету, будет использована в не облагаемых НДС операциях, входной налог нужно будет восстановить, в том числе с учетом пропорции, если использованы они будут одновременно в облагаемой и необлагаемой деятельности (пп. 2 п. 3 ст. 170 Налогового кодекса РФ, письмо Минфина России № 03-07-11/394 от 11 сентября 2007 г.).

Б) Не принимать к вычету входной налог, посчитав такие товары (работы, услуги) предназначенными для использования в не облагаемых НДС операциях (п. 2 ст. 170 Налогового кодекса РФ), и учесть всю его сумму в их стоимости. Если в дальнейшем часть товаров (работ, услуг) будет использована в облагаемых НДС операциях, входной налог можно будет принять к вычету, в том числе с учетом пропорции, если использованы они будут одновременно в облагаемой и необлагаемой деятельности (пп. 2 п. 3 ст. 170 Налогового кодекса РФ, письмо Минфина России № 03-07-11/230 от 1 июня 2010 г.).

В) Всю сумму входного налога принять к вычету и учесть в стоимости по пропорции, определяемой в соответствии с п. 4.1 ст. 170 Налогового кодекса РФ, по товарам (работам, услугам), в том числе основным средствам и материалам, используемым и в облагаемых, и в не облагаемых НДС операциях. При этом пропорция определяется на основании данных о реализации за текущий налоговый период, то есть за период приобретения товаров (работ, услуг), входной НДС по которым нужно распределить. В дальнейшем пропорция может быть скорректирована.

Исключением для последних двух вариантов является случай, когда по итогам квартала доля совокупных расходов на приобретение, производство и (или) реализацию товаров (работ, услуг, имущественных прав), не облагаемых НДС, не превышает 5 процентов от общей величины расходов на приобретение, производство и (или) реализацию товаров (работ, услуг, имущественных прав). Тогда сумму входного НДС, предъявленного продавцом, между операциями можно не распределять, а принять к вычету.

состав расходов, НДС по которым можно принимать к вычету, если доля совокупных расходов налогоплательщика на приобретение, производство и (или) реализацию товаров (работ, услуг), имущественных прав, операции по реализации которых не подлежат налогообложению, не превышает 5 процентов.

Однако данное правило не действует, если необлагаемый вид деятельности находится на спецрежиме, в рамках которого НДС не уплачивается. Например, при приобретении товаров, которые будут использоваться в деятельности на ОСНО и спецрежиме в виде ЕНВД.
Подтверждение: абз. 7 п. 4 ст. 170 Налогового кодекса РФ.

При восстановлении налога (первый вариант) правило "5 процентов" не применяется (письма Минфина России № 03-07-11/40358 от 27 июня 2017 г., № 03-07-11/20205 от 5 апреля 2017 г.).